アーカイブ

１．歴史・民俗資料

北海道指定文化財および利尻町指定文化財各４点を含む島内遺跡から発掘された考古学資料 、島内で唯一現存する「枠船」、鰊漁に関する漁具などのほか、生活用具などが収集・保存され、一部については展示でご紹介しています。
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２．自然史資料

地学、菌類、植物（松野力蔵コレクションなど）、動物など、自然史系の資料・標本、約5000点を所蔵しています。

新種記載論文で用いられた、その種の基準となる標本（タイプ標本）のうち、パラタイプ標本も所蔵しています。パラタイプデータベースはこちらからご覧ください。

3．動画

博物館ではオリジナルの映像記録を近年残すようにしています。自然に関するショートムービーなど一部はこちらからもご覧になれます。

4．文献

古い行政資料や書籍・図鑑のほか、全国からの交換文献（博物館紀要、研究報告など）、昭和47年からの北海道新聞（朝刊、夕刊）および日刊宗谷が保管（１部欠落あり）されています。